El Instituto de Educación Superior Pedagógico Público “Gran Pajatén” se crea por clamor del pueblo, dada la necesidad de un Centro Superior de Estudios en nuestra provincia.

En el año de 1983, mediante R.V.M. Nº 1380-83-ED se autoriza el funcionamiento del Programa de Formación de Profesores de Educación Primara en la ciudad de Juanjuí, dependiente del Instituto Superior Pedagógico Estatal de Tarapoto. En 1986, mediante el D.S. Nº 19-86-ED del 30 de diciembre de 1986, nuestra institución adquiere su autonomía con el nombre de Instituto Superior Pedagógico Juanjuí.
La Resolución Directoral Nº 266-96-ED de fecha 28 de mayo de 1996, autoriza el cambio de denominación de Instituto Superior Pedagógico Público Juanjuí a INSTITUTO SUPERIOR PEDAGÓGICO PÚBLICO “GRAN PAJATÉN”.
El 12 de Diciembre del 2002, mediante el D. S. N° 050-2002-ED, obtiene su reinscripción. Con la Ley Nº 29394 Ley de Institutos y Escuelas de Educación Superior y su Reglamento, aprobado mediante D. S. Nº 004-2010-ED, se modifica su denominación a INSTITUTO DE EDUCACIÓN SUPERIOR PEDAGÓGICO PÚBLICO “GRAN PAJATÉN”.